Чрут (команда chroot, от англ. change root) — это временная смена корня. Может выполняться с разными целями. Например, загружаемся с ALT Rescue флэшки и чиним поломанную систему или меняем забытый пароль пользователя root, для чего монтируем корень целевой системы и делаем в него чрут. Все нижеописанные действия требуют полномочий пользователя root.
В разных дистрибутивах линукс переход в чрут осуществляется по разному , вот пример перехода в чрут на примере дистрибутива Арч линукс : пример (кликабельно)